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生物信息学平台
来源:信息中心 时间:2014年03月24日 09:45
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建立时间:2010年1月
依托单位:北京诺赛基因组研究中心有限公司/国家人类基因组北方研究中心
平台概况:
诺赛基因是中国最早开展专业化生物信息学分析服务的机
构之一,引入了Illumina Hiseq高通量测序平台,提高了单次测序数据量,降低了实验成本,完善了小RNA测序技术服务流程,新建了独立的RNA提取室,保证了服务质量,在小RNA测序、表达谱分析等高通量测序应用领域取得市场领先。拥有一支经验丰富、实力雄厚的生物信息团队信息室拥有一台25节点的高性能CLUSTER服务器、一台单节点配备500G内存和32核心的计算服务器、数台网络和数据库服务器和两台容量为30T的高性能磁盘阵列。
服务内容:
1、结合Roche的454和Illumina GA两大技术平台,提供成熟且高质量的物种全基因组测序、转录组、数字化表达谱、小RNA、宏基因组、免疫共沉淀、人类外显子组等高通量测序服务及后续的相关生物信息学分析服务。
2、针对高通量(NGS)的主流应用,开发和升级相应的分析流程;包括技术支持,包括前期文献调研、实验方案设计、后期结果解释。
3、开发NGS数据的云计算应用。
主要业绩:
能胜任各种分析任务,包括全基因组测序,转录组测序、宏基因组测序、小RNA测序、表达谱分析、de novo测序、重测序、ChIP-seq、甲基化等,涉及物种包括人、猪、牛、鼠、水稻、玉米、大豆、拟南芥、桉树、烟草、棉花、蘑菇、土壤微生物及其他多种微生物等,样本总数超过300例。采用诺赛自制试剂,能够从很多困难样本中获得足够的核酸,且文库构建需要的起始核酸量也较低,在用户中获得了数据质量高、分析结果细致及提供系统性解决方案的良好口碑。
可应用于序列比对、结构和功能预测、分子进化、重要
基因及位点关联分析等机理研究以及数据库建立。目前诺赛正在和医院以及相关生物医药企业合作,将高通量测序平台应用于转化医学领域。而MicroRNA测序主要用于疾病,如肿瘤、糖尿病等的机理研究。
相关资质:
ISO9001:2008质量管理体系认证、基因组学研究北京市重点实验室、北京市科技研发机构
联系人:
张晓柠,67883332-860,zhangxiaoning@chgb.org.cn
地址:北京经济技术开发区永昌北路3号707
平台图片:
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